新疆瑞源乳业有限公司成立于2001年，经过十七年的发展，由10万元起家的一个校办小厂发展成为国家级农业产业化重点龙头企业、国家学生奶定点生产企业、高新技术企业、自治区产学研联合开发示范基地、两化融合示范企业、自治区扶贫龙头企业，科技创新型企业，也是新疆最大的干酪工业化生产企业。目前主要产品为牛乳精深加工制品，有8大类40多个品种。企业也形成了以奶牛标准化养殖为基础、干制奶酪生产为重点、乳清系列产品、特色酸奶系列产品为新经济增长点、产业链延伸发展、科技含量不断提高的循环经济经营发展模式。
2017年瑞源乳业与时俱进，不断创新，生产基地被评为国家高新技术企业、全国主食加工示范企业；研发中心被评为自治区级企业技术中心、自治区工程实验室；瑞源产品获得自治区优秀新产品奖；瑞源乳业通过技术创新、工艺改进、产业升级打造为全疆首家特色乳品智能化绿色工厂。
同时公司与国内知名的中国农业大学、东北农业大学、新疆农业大学和新疆轻工职业技术学院的教授专家们共同在发酵乳技术上不断交流，开发出多种具有浓郁地方特色乳品，在继公司的液态奶系列妈妈的味道，奶疙瘩系列铁木真的干粮，乳清酒、乳清醋系列天山金露等创新产品外；2017年又推出了谷物类营养代餐系列、年轻人系列和地方特色系列酸奶产品：燕麦仁酸奶、富硒黑麦酸奶、爆火酸奶、玫瑰爆火酸奶，同时推出具有罗斯风味的烤酸奶和具有新疆地方特色的黑枸杞酸奶及黑枸杞产品等一系列特色酸奶。
2012年新疆瑞源乳业有限公司全额投资设立全资子公司：新疆凯瑞可食品科技有限公司，注册资金2000万元。目前拥有年产9万吨牛奶综合加工农业循环经济项目，是瑞源乳业进行生产规模扩建和技术升级后集工业旅游、科普教育、休闲观光于一体的大型现代化乳制品生产基地。2014年5月18日正式投产运行，目前有员工126人。秉承母公司十六年发展的产业模式及优良传统成为新疆最大的干酪工业化生产企业，年产量占新疆工业化干酪年产总量的40%。企业也发展成为国家高新技术企业、全国主食加工业示范企业，自治区产学研联合开发示范基地，自治州农业产业化龙头企业，拥有一个自治区级的企业技术中心，一个工程实验室。2017年公司投资4000多万元进行技术改造，引进了国内最先进的利乐全自动化设备，使企业的工业化生产由自动化迈向智能化，进一步提升了产品的产量及品质。引进利乐生产自动化及MES、全业务链质量追溯系统，建立基于工业互联网的智能车间，实现产品及生产过程虚拟仿真、研发制造一体化、企业资源管理与制造执行系统集成等应用模式，成为自治区首家先进的乳品智能化生产工厂。
企业通过产学研联合开发等科研形式，建立了从养殖→液态奶系列产品→奶酪产品→乳清酒→乳清醋饮并辅以产品研发的全产业链产业模式。目前拥有专利20项，其中发明专利10项（自治区发明专利一等奖1个）、实用新型专利2项、外观设计专利8项、55个注册商标、1个自治区级科技成果，3个自治州级科技成果，4个市级科技成果。核心技术覆盖饲草种植、奶牛标准化养殖、奶酪生产、乳清综合利用、乳清营养酒制备、乳清营养醋制备、坚果奶酪技术、特色酸奶加工技术等主要环节，成为国内乳品行业独具特色的产业链延伸最长，附加值最高的科技型、创新型企业之一。产品销售区域扩展到北京、上海、山东、江苏、四川等全国60%的区域。
企业借助民族地方特色产业在发展的同时，扶持当地少数民族农民致富，成带动了5000多户少数民族奶牛养殖专业户走向市场。今后公司也将继续以科技领航，勇于开拓，为实现生态的瑞源、大爱的瑞源、社会的瑞源而不断努力。
